More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1123 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  100 
 
 		 836 aa  1613    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  75.36 
 
 		 393 aa  293  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  73.79 
 
 		 393 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  62.68 
 
 		 401 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  62.93 
 
 		 413 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  63.16 
 
 		 408 aa  230  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  59.33 
 
 		 408 aa  209  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  50.22 
 
 		 422 aa  181  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  48.57 
 
 		 436 aa  171  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  48.58 
 
 		 395 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  40.83 
 
 		 389 aa  154  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  42.11 
 
 		 390 aa  144  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.17 
 
 		 396 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  37.74 
 
 		 398 aa  126  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  39.6 
 
 		 389 aa  124  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  37.74 
 
 		 457 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  37.17 
 
 		 342 aa  117  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  40.78 
 
 		 418 aa  117  8.999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.22 
 
 		 352 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  36.2 
 
 		 417 aa  114  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  38.33 
 
 		 418 aa  114  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  31.7 
 
 		 401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  38.97 
 
 		 404 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.18 
 
 		 422 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  40.55 
 
 		 385 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  31.08 
 
 		 407 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  31.13 
 
 		 402 aa  110  9.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  33.96 
 
 		 408 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.98 
 
 		 318 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  35.96 
 
 		 396 aa  108  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  42.04 
 
 		 448 aa  108  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34.91 
 
 		 409 aa  107  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.8 
 
 		 321 aa  107  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  34.16 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  36.02 
 
 		 322 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.57 
 
 		 396 aa  104  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.72 
 
 		 323 aa  105  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  36.32 
 
 		 391 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  29.41 
 
 		 410 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  32.89 
 
 		 399 aa  104  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  31.19 
 
 		 405 aa  104  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  37.22 
 
 		 418 aa  104  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.46 
 
 		 408 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  35.21 
 
 		 321 aa  103  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  36.08 
 
 		 396 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  34.48 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  32.34 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.52 
 
 		 321 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  33.14 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  35.44 
 
 		 399 aa  103  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  34.87 
 
 		 381 aa  102  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  35 
 
 		 322 aa  102  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  37.44 
 
 		 335 aa  100  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.76 
 
 		 401 aa  100  8e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.19 
 
 		 298 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  33 
 
 		 416 aa  99.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  33.19 
 
 		 314 aa  99.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  34.48 
 
 		 396 aa  99.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  36.24 
 
 		 400 aa  99.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  28.64 
 
 		 408 aa  99.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  35.32 
 
 		 303 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  32.49 
 
 		 322 aa  99.4  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  35.12 
 
 		 395 aa  99  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  37.44 
 
 		 387 aa  99  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.43 
 
 		 315 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.43 
 
 		 315 aa  99  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  41.18 
 
 		 393 aa  98.6  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 405 aa  98.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  38.58 
 
 		 381 aa  98.6  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  33.8 
 
 		 407 aa  98.2  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  36.36 
 
 		 306 aa  98.6  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  34.6 
 
 		 406 aa  98.6  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  34.95 
 
 		 314 aa  98.2  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.85 
 
 		 395 aa  98.2  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  35.81 
 
 		 392 aa  98.2  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  34.58 
 
 		 406 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  34.58 
 
 		 406 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  34.58 
 
 		 406 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  32.47 
 
 		 325 aa  97.8  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  34.58 
 
 		 406 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  34.58 
 
 		 406 aa  97.8  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.17 
 
 		 401 aa  97.8  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.66 
 
 		 321 aa  97.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  34.08 
 
 		 405 aa  97.4  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  36.53 
 
 		 336 aa  97.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30 
 
 		 400 aa  96.7  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.11 
 
 		 410 aa  97.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.36 
 
 		 300 aa  97.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  31.16 
 
 		 400 aa  96.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.33 
 
 		 320 aa  97.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.07 
 
 		 334 aa  96.3  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  37.21 
 
 		 306 aa  96.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>