More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5345 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  100 
 
 		 417 aa  815    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  42.86 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  39.61 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  38.96 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  40.05 
 
 		 382 aa  203  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  35.97 
 
 		 417 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.97 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  38.98 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  36.36 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  37.22 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  35.48 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  33.16 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  33.42 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.32 
 
 		 395 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.85 
 
 		 400 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  36.25 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  33.18 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.37 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  33.58 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.75 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.83 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.25 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.32 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.98 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  33.43 
 
 		 404 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  35.73 
 
 		 408 aa  153  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.62 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  33.67 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.69 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  33.42 
 
 		 401 aa  149  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  34.16 
 
 		 393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  33.08 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  38.68 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  33.79 
 
 		 400 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  30.02 
 
 		 399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  29.73 
 
 		 409 aa  146  6e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.32 
 
 		 410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  39.41 
 
 		 473 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.65 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  32.91 
 
 		 413 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.73 
 
 		 414 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.25 
 
 		 399 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  34.32 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.27 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  33.77 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.05 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  34.15 
 
 		 408 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  30.81 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  34.83 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.46 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.1 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  35.74 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.57 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  30.57 
 
 		 393 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.11 
 
 		 386 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  33.25 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.54 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  35.24 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.39 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  31.34 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.69 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.66 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.35 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.18 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  33.71 
 
 		 382 aa  133  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.15 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.02 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.94 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.77 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.99 
 
 		 387 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.36 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.43 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.77 
 
 		 401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.53 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.07 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  33.82 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  27.66 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.43 
 
 		 312 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  31.44 
 
 		 385 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.59 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  34.14 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  30.1 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  31.75 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.03 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  29.17 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.87 
 
 		 315 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.87 
 
 		 315 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  34.64 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.3 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  36.73 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.74 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.47 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.15 
 
 		 425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.57 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  28.97 
 
 		 395 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.25 
 
 		 352 aa  121  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  29.79 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  31.86 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.07 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>