More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2670 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  100 
 
 
408 aa  779    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  70.18 
 
 
413 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  70.5 
 
 
401 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  66.41 
 
 
408 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  59.6 
 
 
393 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  59.6 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  54.02 
 
 
422 aa  338  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  44.84 
 
 
395 aa  270  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  45.48 
 
 
436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  43.4 
 
 
389 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  63.16 
 
 
836 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  42.6 
 
 
390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  39.8 
 
 
404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  40.36 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  40.2 
 
 
418 aa  180  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  38.97 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  36.56 
 
 
457 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  34.33 
 
 
418 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.82 
 
 
408 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  34.2 
 
 
417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  35.31 
 
 
417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  33.33 
 
 
410 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.94 
 
 
398 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  33.51 
 
 
404 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  34.11 
 
 
382 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.03 
 
 
396 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  31.55 
 
 
413 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.69 
 
 
409 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  39.27 
 
 
473 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  34.72 
 
 
403 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.57 
 
 
400 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.58 
 
 
383 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  34.47 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.34 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.01 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.63 
 
 
322 aa  140  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.59 
 
 
395 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  32.64 
 
 
406 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  33.16 
 
 
403 aa  139  8.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.33 
 
 
408 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.69 
 
 
405 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  33.93 
 
 
392 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  28.57 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  29.37 
 
 
435 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.68 
 
 
405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.64 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.91 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  35.55 
 
 
401 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.24 
 
 
404 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.83 
 
 
387 aa  133  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.23 
 
 
434 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  35.35 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  29.59 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  27.73 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.48 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  26.97 
 
 
408 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  26.97 
 
 
408 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.32 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  26.92 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  26.92 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  29.98 
 
 
409 aa  129  6e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.09 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.09 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.09 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.09 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.09 
 
 
406 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  24.23 
 
 
385 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  27.66 
 
 
405 aa  129  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  29.55 
 
 
416 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.62 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  27.39 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  35.58 
 
 
321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.71 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.3 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
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NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.64 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.11 
 
 
396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.9 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  26.72 
 
 
408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.09 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.72 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.9 
 
 
397 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.25 
 
 
404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.78 
 
 
399 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  35.81 
 
 
306 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  33.25 
 
 
409 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  26.3 
 
 
405 aa  126  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.3 
 
 
408 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.61 
 
 
397 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  26.89 
 
 
378 aa  126  9e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.77 
 
 
416 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  29.2 
 
 
407 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  34.27 
 
 
438 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
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