More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19960 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
325 aa  654    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0320  ROK family protein  41.97 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0261245  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.3 
 
 
323 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  35.6 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  34.28 
 
 
312 aa  152  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.02 
 
 
321 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  36.74 
 
 
317 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  34.8 
 
 
327 aa  150  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  30.79 
 
 
313 aa  149  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.95 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.68 
 
 
321 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.44 
 
 
317 aa  142  9e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.69 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.25 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  35.87 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  32.08 
 
 
320 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  31.53 
 
 
302 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34.47 
 
 
322 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.46 
 
 
298 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.95 
 
 
352 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.13 
 
 
306 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  35.11 
 
 
312 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  35.35 
 
 
318 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  30.42 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  33.33 
 
 
323 aa  137  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.62 
 
 
317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  32.17 
 
 
304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.25 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.92 
 
 
347 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  34.08 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.67 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  34.3 
 
 
298 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  32.81 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  35.76 
 
 
316 aa  133  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32.05 
 
 
321 aa  132  6e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33.88 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.72 
 
 
316 aa  132  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.7 
 
 
315 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.66 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  32.14 
 
 
299 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  35.71 
 
 
319 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.19 
 
 
314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  31.53 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  33.12 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.83 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.13 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.75 
 
 
315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32.67 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  30.12 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32.67 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.57 
 
 
300 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.38 
 
 
315 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  33.02 
 
 
323 aa  126  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.97 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  30.92 
 
 
292 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  33.73 
 
 
320 aa  123  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.97 
 
 
315 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.97 
 
 
315 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.64 
 
 
387 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  36.08 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.85 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  34.19 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.98 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  36.23 
 
 
321 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  31.09 
 
 
313 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  28.22 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.57 
 
 
400 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.58 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  29.51 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  32.28 
 
 
303 aa  119  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.45 
 
 
300 aa  119  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  32.8 
 
 
306 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  37.77 
 
 
326 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  32.49 
 
 
332 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  30.19 
 
 
306 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.82 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.13 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  33.23 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  27.42 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  31.15 
 
 
313 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  30.46 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  33.65 
 
 
314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  30.19 
 
 
302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  28.3 
 
 
292 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  31.29 
 
 
314 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  31.39 
 
 
307 aa  116  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  24.44 
 
 
405 aa  116  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  30.19 
 
 
302 aa  116  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1605  ROK family glucokinase  30.38 
 
 
328 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.17 
 
 
308 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1639  ROK family glucokinase  30.38 
 
 
328 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.352647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>