More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3083 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  100 
 
 		 407 aa  795    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3308  ROK family protein  35.2 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.715302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3099  ROK family protein  38.25 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1023  ROK family protein  39.41 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164512  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1190  ROK family protein  28.43 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.0524506 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  32.23 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  34.78 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  33.17 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  34.19 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  33.51 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  34.63 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  33.84 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  34.62 
 
 		 393 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  35.35 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.24 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.13 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.99 
 
 		 403 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  31.5 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.1 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  33.07 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.01 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  31.17 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  38.32 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  26.5 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  31.52 
 
 		 413 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.1 
 
 		 410 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  23.57 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.6 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  28.82 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.58 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  23.12 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  29.38 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  27.94 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.92 
 
 		 396 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.31 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.79 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.51 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  30.3 
 
 		 418 aa  98.2  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.96 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  32.4 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.24 
 
 		 381 aa  96.7  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  29.12 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.57 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.74 
 
 		 398 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.91 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.31 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.32 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.37 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.75 
 
 		 417 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  25.84 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  27.96 
 
 		 448 aa  93.2  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  32.62 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.57 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  27.73 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  21.65 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.61 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  31.03 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  31.4 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.57 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.65 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  21.77 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  32.51 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.37 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  29.82 
 
 		 404 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.51 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  28.93 
 
 		 392 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.25 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.39 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  34.07 
 
 		 836 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.98 
 
 		 395 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  29.82 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  36.2 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  29.47 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.32 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.61 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.5 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.52 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  22.29 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  32.64 
 
 		 335 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  27.69 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.57 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.46 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  23.06 
 
 		 407 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.38 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  30.89 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.54 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.06 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  31.55 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  30.08 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.91 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.82 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  33.2 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.19 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  34.36 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.13 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.45 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  28.83 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.74 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.95 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>