More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1023 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1023  ROK family protein  100 
 
 		 387 aa  711    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164512  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3308  ROK family protein  43.17 
 
 		 404 aa  237  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.715302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  39.41 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3099  ROK family protein  41.94 
 
 		 385 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1190  ROK family protein  31.58 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.0524506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  35.14 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  36.5 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.21 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  36.01 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  32.98 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  36.01 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  34.47 
 
 		 408 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  31.88 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  31.84 
 
 		 401 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  31.76 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.18 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  24.74 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.79 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  26.17 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.6 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.21 
 
 		 405 aa  103  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  33.24 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.56 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.69 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  29.56 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  34.09 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.41 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  33.08 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  32.94 
 
 		 403 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  34.3 
 
 		 403 aa  99.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.06 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  30.91 
 
 		 404 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  33.6 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.4 
 
 		 408 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  24.52 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.4 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.37 
 
 		 389 aa  95.9  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  30.81 
 
 		 390 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  32.29 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.26 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.56 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.91 
 
 		 398 aa  94.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  37.45 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  22.75 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.78 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.2 
 
 		 401 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.55 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.67 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.35 
 
 		 312 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  36.82 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.33 
 
 		 408 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.03 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.37 
 
 		 402 aa  90.9  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  32.23 
 
 		 413 aa  90.1  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.63 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.51 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  34.55 
 
 		 406 aa  89.4  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.05 
 
 		 396 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.61 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.98 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.88 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.63 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.41 
 
 		 391 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  19.17 
 
 		 388 aa  87  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  31.23 
 
 		 385 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.74 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  31.17 
 
 		 325 aa  86.3  9e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  21.17 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  20 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  34.07 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.25 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  37.02 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  33.68 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  33.33 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  34.23 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.73 
 
 		 503 aa  83.2  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.78 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.81 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.1 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.73 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  31.91 
 
 		 392 aa  80.9  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.22 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.69 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  36.79 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  25.32 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.97 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.45 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.66 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.37 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.13 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.13 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  39.27 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
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NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  30.95 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
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NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  27.66 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  27.35 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  21.75 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.75 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  34.21 
 
 		 315 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.15 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
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