More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1190 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1190  ROK family protein  100 
 
 		 418 aa  846    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.0524506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3308  ROK family protein  34 
 
 		 404 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.715302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  28.43 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3099  ROK family protein  28.61 
 
 		 385 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1023  ROK family protein  30.73 
 
 		 387 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.164512  normal  0.752053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.37 
 
 		 396 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.48 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  27.64 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  24.7 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  26.25 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  24.94 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.71 
 
 		 406 aa  89.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.57 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  27.51 
 
 		 385 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  22.41 
 
 		 401 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  21.77 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.12 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.03 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  22.25 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  28.22 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.46 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  25.77 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  25.81 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  25 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.34 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  25.15 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  31.82 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  27.54 
 
 		 392 aa  80.1  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  26.48 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  24.28 
 
 		 429 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  27.41 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  26.3 
 
 		 435 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  31.11 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  24.39 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.46 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.53 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  25.69 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.17 
 
 		 352 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.73 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.02 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  24.85 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  24.85 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  26.4 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  24.94 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.12 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  20.99 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  25.53 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  26.32 
 
 		 327 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  21.45 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.88 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  24.87 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.2 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  24.7 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.98 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  25.15 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  24.72 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  22.95 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.96 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  26.51 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  27.8 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  30.45 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  22.62 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  24.37 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  35.71 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  24.41 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  23.61 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.21 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  24.43 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2804  ROK  25.35 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.552236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.04 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  24.02 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.32 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  25.67 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  22.31 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  26.45 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.37 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0832  glucokinase  27.17 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.77 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  24.15 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  25.74 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  24.63 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  29.37 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  27.92 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  24.92 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
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NC_007413  Ava_4339  glucokinase  27.08 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  23.68 
 
 		 393 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  31.07 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
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NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  25 
 
 		 405 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  23.8 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_008578  Acel_0979  glucokinase  29.06 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  28.33 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  27.27 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  23.43 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  23.75 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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