More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4635 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  100 
 
 		 401 aa  770    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  43.58 
 
 		 390 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.53 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  34.38 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  33.68 
 
 		 405 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  30.26 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  32.56 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.06 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  36.16 
 
 		 386 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  32.74 
 
 		 414 aa  156  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.46 
 
 		 410 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.19 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  33.08 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.03 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.52 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.67 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  33.33 
 
 		 425 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.12 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.16 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  33.33 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.01 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.54 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.53 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.76 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.45 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  36.8 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.56 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.24 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  33.05 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.96 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  34.29 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.88 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  32.28 
 
 		 402 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.15 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.61 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.07 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.33 
 
 		 401 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.3 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  31.64 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.43 
 
 		 503 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  28.12 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  28.12 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.27 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  28.12 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  28.12 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  28.12 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  24.6 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  33.42 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  35.52 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  32.42 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.83 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.68 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  33.7 
 
 		 395 aa  133  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.25 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.97 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.77 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  29.11 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  27.84 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.79 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  29.43 
 
 		 407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  30.15 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  27.84 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  27.84 
 
 		 408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.5 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  29.13 
 
 		 407 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.94 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  31.12 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.28 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  33.93 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  35.69 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  35.74 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  36.77 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.7 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  30.03 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  37.04 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.89 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30.79 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  38.08 
 
 		 473 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  34.29 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.35 
 
 		 389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  28.63 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  32.14 
 
 		 414 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.59 
 
 		 416 aa  127  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.77 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.77 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  32.62 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  30.39 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  31.01 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.82 
 
 		 364 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  31.88 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.62 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>