More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0149 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  100 
 
 		 473 aa  917    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  69.45 
 
 		 391 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  46.59 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  53.78 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  50.37 
 
 		 382 aa  207  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  47.48 
 
 		 406 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  45.05 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  43.73 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  44.96 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  39.56 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  46.01 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  45.74 
 
 		 438 aa  176  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  44.8 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  49.1 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  41.95 
 
 		 403 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  41.04 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  41.98 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  37.93 
 
 		 409 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  41.61 
 
 		 457 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  41.91 
 
 		 401 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  42.07 
 
 		 392 aa  157  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  42.18 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  37.69 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  38.65 
 
 		 387 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  37.36 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  36.43 
 
 		 400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  43.23 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  38.16 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  41.18 
 
 		 390 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  39.13 
 
 		 383 aa  143  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  37.59 
 
 		 397 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  40.07 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  33.58 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  37.88 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  39.53 
 
 		 417 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  41.85 
 
 		 398 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  33.72 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.6 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.15 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  36.16 
 
 		 425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.63 
 
 		 396 aa  134  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  37.82 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  34.29 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  35.06 
 
 		 425 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  37.35 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  38.15 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  40.88 
 
 		 383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  39.42 
 
 		 416 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  36.8 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  36.14 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  34.09 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  37.05 
 
 		 393 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  37.72 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  33.09 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  44.75 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  38.38 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  41.85 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  36.26 
 
 		 422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  34.94 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  38.93 
 
 		 413 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.99 
 
 		 398 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  37.73 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  37.27 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  31.48 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  36.3 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  39.27 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  37.16 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  32.07 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  39.1 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  34.29 
 
 		 386 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  36.73 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  32.73 
 
 		 417 aa  123  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  38.91 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.26 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.04 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.52 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  37.31 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  35.29 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  32.17 
 
 		 378 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  32.01 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  31.07 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  36.33 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  35.11 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.76 
 
 		 383 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  26.74 
 
 		 390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  30.5 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  37.64 
 
 		 387 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  31.72 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  37.68 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  31.43 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  37.23 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  32.52 
 
 		 410 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.03 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  37.55 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  32.22 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  36.86 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  38.43 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  36.88 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  35.74 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  35 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>