More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22700 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 413 aa  808    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  59.28 
 
 		 382 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  40.44 
 
 		 410 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  42.82 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  42.08 
 
 		 406 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  42.5 
 
 		 404 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  43.72 
 
 		 406 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  39.59 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  37.84 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  39.11 
 
 		 448 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  33.17 
 
 		 409 aa  196  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  38.84 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  46.38 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  38.85 
 
 		 438 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  37.22 
 
 		 417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  38.93 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.56 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  41.97 
 
 		 418 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.08 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  39.95 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.96 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.51 
 
 		 409 aa  162  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  38.83 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  35.66 
 
 		 457 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  36.68 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  35.71 
 
 		 409 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  34.25 
 
 		 392 aa  156  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.5 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  35.41 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  37.55 
 
 		 387 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.46 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  31.39 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  33.33 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.44 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  33.82 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  30.46 
 
 		 400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  36.02 
 
 		 408 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  33.61 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.04 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.14 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.89 
 
 		 400 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  35.73 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  33.17 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.51 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.91 
 
 		 404 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.92 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  34.13 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  32.6 
 
 		 395 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30.67 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  31.34 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.56 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.75 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.02 
 
 		 364 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  34.87 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  35.19 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  33.42 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  39.01 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  33.75 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  34.68 
 
 		 403 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.72 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.75 
 
 		 396 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.04 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.79 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.71 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  27.52 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.91 
 
 		 434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.92 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.07 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  39.29 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  34.22 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.86 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  34.6 
 
 		 306 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.69 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.2 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.78 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  33.33 
 
 		 417 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  32.26 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.43 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.92 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.62 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.97 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.61 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.22 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.61 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  28.61 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  36.31 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  34.04 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.79 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.4 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.43 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>