More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1858 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  100 
 
 		 389 aa  785    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  48.18 
 
 		 401 aa  344  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  46.22 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  47.04 
 
 		 418 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  49.01 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  44.41 
 
 		 402 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  38.24 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  35.56 
 
 		 389 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  37.43 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  35.81 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.8 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.63 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.53 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.98 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  31.59 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.68 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.52 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.78 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.52 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  32.99 
 
 		 410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.35 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.65 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.03 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.57 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.01 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.17 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.65 
 
 		 410 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.4 
 
 		 408 aa  154  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.18 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.11 
 
 		 503 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  29.36 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.01 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.13 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.79 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.04 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  28.82 
 
 		 408 aa  144  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  30.77 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.97 
 
 		 364 aa  143  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.23 
 
 		 417 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.97 
 
 		 386 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  31.15 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.36 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.37 
 
 		 406 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  29.74 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  29.46 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  30.11 
 
 		 407 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.27 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  28.35 
 
 		 406 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.38 
 
 		 383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.25 
 
 		 407 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.52 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.61 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.52 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.52 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.22 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  28.17 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.84 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  31.74 
 
 		 401 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  27.4 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  28 
 
 		 403 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  28.86 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.51 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.06 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  30.41 
 
 		 389 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  24.24 
 
 		 406 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  24.24 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.61 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.25 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.25 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  27.3 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  27.76 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.97 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.09 
 
 		 395 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.07 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  27.78 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  28.19 
 
 		 405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.93 
 
 		 420 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  28.39 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.25 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.4 
 
 		 399 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  25.61 
 
 		 372 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.16 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.36 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.16 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  31.32 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.36 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.17 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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