More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0256 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  100 
 
 		 393 aa  755    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  37.87 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  37.18 
 
 		 396 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  36.84 
 
 		 401 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  37.53 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  37.2 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  39.58 
 
 		 387 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  39.23 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  37.08 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  36.08 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.59 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  37.79 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  32.38 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  34.1 
 
 		 420 aa  166  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.99 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  35.64 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.79 
 
 		 429 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.44 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  34.29 
 
 		 410 aa  152  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.94 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.23 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.24 
 
 		 397 aa  149  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.86 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  31.83 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.73 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.2 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.33 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  34.68 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  27.25 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  27.53 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  27.64 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  26.99 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  26.99 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  26.99 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  26.99 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  26.99 
 
 		 406 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  27.05 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.71 
 
 		 503 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05680  transcriptional regulator/sugar kinase  31.27 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.244625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  26.67 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  27.05 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  26.67 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  26.74 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  27.05 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  26.67 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  26.11 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  32.57 
 
 		 403 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  26.22 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  34.82 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  32.39 
 
 		 372 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
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NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.7 
 
 		 448 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  32.7 
 
 		 318 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.94 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  31.56 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
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NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  25.2 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  25.2 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.96 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.36 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.21 
 
 		 402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  33.81 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25 
 
 		 385 aa  125  9e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.69 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  23.76 
 
 		 405 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  23.44 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.81 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  31 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.1 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  29.66 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.13 
 
 		 405 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.06 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  29.12 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.32 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.84 
 
 		 403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  23.44 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.01 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 405 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  29.68 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.61 
 
 		 408 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  23.96 
 
 		 405 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  21.7 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.53 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  24.43 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  26.55 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  29.91 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.77 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.04 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  22.22 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.38 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  29.72 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
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NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.34 
 
 		 392 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.07 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.92 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  21.88 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.64 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  23.87 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.85 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  24.72 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.62 
 
 		 315 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.09 
 
 		 418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  30.33 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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