More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5336 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  100 
 
 		 392 aa  752    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  53.33 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  48.95 
 
 		 395 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  51.3 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  49.48 
 
 		 395 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  47.97 
 
 		 410 aa  316  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  53.7 
 
 		 503 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  47.84 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  50.14 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  51.63 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  43.24 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  43.42 
 
 		 427 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  44.44 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  45.92 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  42.39 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  45.93 
 
 		 372 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  40.79 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  40.92 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  40.11 
 
 		 381 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  39.77 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  39.27 
 
 		 381 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  38.24 
 
 		 405 aa  215  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  38.67 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  43.88 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  41.87 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  41.16 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  37 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  40.16 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  33.69 
 
 		 400 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  36.73 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  34.95 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  36.41 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.48 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  34.84 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  37.18 
 
 		 401 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  36.02 
 
 		 408 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  34.95 
 
 		 393 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.33 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.45 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.45 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  34.23 
 
 		 429 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  33.16 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  33.43 
 
 		 396 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  36.61 
 
 		 406 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  33.52 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  32.67 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  35.31 
 
 		 420 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  33.06 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  34.38 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.35 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.42 
 
 		 410 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  34.68 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.11 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  34.38 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.01 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.06 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.73 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.66 
 
 		 321 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.06 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.31 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.74 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.74 
 
 		 315 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  35.08 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.65 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.32 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.7 
 
 		 318 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.42 
 
 		 408 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.59 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.47 
 
 		 400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.4 
 
 		 400 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  27.41 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.91 
 
 		 321 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.65 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  30.22 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.37 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  32.54 
 
 		 335 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.86 
 
 		 408 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  31.3 
 
 		 455 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.53 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.5 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.4 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.79 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.5 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.75 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.53 
 
 		 399 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  33.69 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.13 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  31.58 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  24.93 
 
 		 407 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.01 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.04 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.68 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.94 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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