More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0174 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  100 
 
 		 406 aa  806    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  44.9 
 
 		 429 aa  290  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  37.63 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  36.58 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  35.68 
 
 		 406 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  37.83 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  38.16 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  38.1 
 
 		 503 aa  203  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  36.53 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  35.32 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  36.99 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  37.78 
 
 		 405 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  36.42 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  39.38 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  36.15 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.86 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  35.11 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  33.33 
 
 		 372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  36.31 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.67 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  37.24 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.59 
 
 		 389 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  32.48 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.48 
 
 		 401 aa  149  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  32.69 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  32.88 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  31.49 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.34 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.37 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.41 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  32.33 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  30.31 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.37 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.83 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  31.46 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  33.68 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.67 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  30.18 
 
 		 392 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.49 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.13 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.86 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.33 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.49 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.77 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.26 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  31.47 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.31 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.49 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.6 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.13 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.41 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.98 
 
 		 321 aa  123  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.99 
 
 		 405 aa  123  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.42 
 
 		 420 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  33.16 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  24.8 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.82 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.95 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  24.93 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.54 
 
 		 372 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.53 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.72 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  32.36 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  28.35 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.63 
 
 		 396 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.4 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.23 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.57 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.59 
 
 		 418 aa  116  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.74 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.83 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27.73 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.51 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  28.7 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  28.57 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  31.5 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  28.57 
 
 		 327 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.84 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.39 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  24.78 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.38 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  28.15 
 
 		 404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.34 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  28.75 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.58 
 
 		 395 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  31.54 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  24.74 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.38 
 
 		 327 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  26.83 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.81 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.66 
 
 		 401 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
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