More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1919 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  87.19 
 
 
406 aa  732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  87.19 
 
 
406 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  86.95 
 
 
406 aa  730    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  732    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  87.19 
 
 
406 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  100 
 
 
407 aa  830    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  733    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  87.19 
 
 
406 aa  732    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  732    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  87.19 
 
 
406 aa  733    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  75.25 
 
 
405 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  73.02 
 
 
405 aa  625  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  73.02 
 
 
405 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  73.32 
 
 
405 aa  617  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  73.02 
 
 
405 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  72.7 
 
 
405 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  72.7 
 
 
405 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  47.15 
 
 
405 aa  408  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  46.9 
 
 
434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  46.52 
 
 
416 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  45.41 
 
 
405 aa  395  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  40.8 
 
 
404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  40.4 
 
 
406 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  40.65 
 
 
406 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  40.65 
 
 
406 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  40.65 
 
 
406 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  40.65 
 
 
406 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  40.65 
 
 
406 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  39.9 
 
 
406 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  40.15 
 
 
407 aa  315  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  40.15 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 
408 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  40.15 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  38.97 
 
 
406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  38.65 
 
 
404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  38.4 
 
 
407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  37.91 
 
 
404 aa  299  5e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  37.41 
 
 
404 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  37.91 
 
 
407 aa  296  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  33.17 
 
 
408 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.61 
 
 
408 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.59 
 
 
410 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.82 
 
 
410 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.9 
 
 
400 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.77 
 
 
386 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.2 
 
 
407 aa  149  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0757  NagC-like transcriptional regulator  25.87 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00860509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.56 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.08 
 
 
396 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.29 
 
 
401 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  27.25 
 
 
420 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.94 
 
 
428 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.23 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.53 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.6 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.34 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  25.13 
 
 
402 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  24.94 
 
 
396 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.45 
 
 
408 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  26.23 
 
 
393 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.2 
 
 
383 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.37 
 
 
389 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  27.25 
 
 
393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  28.64 
 
 
401 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  29.6 
 
 
390 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.74 
 
 
391 aa  136  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.65 
 
 
396 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.13 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.58 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.44 
 
 
425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  25.77 
 
 
387 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.92 
 
 
315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.92 
 
 
315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  30.38 
 
 
332 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  25 
 
 
322 aa  133  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.61 
 
 
389 aa  132  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.7 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  28.72 
 
 
371 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  29.19 
 
 
340 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.49 
 
 
321 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.86 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.21 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.46 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.77 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  29.23 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.54 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>