More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1608 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  100 
 
 		 416 aa  805    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  55.99 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  54.81 
 
 		 403 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  46.13 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  40.87 
 
 		 417 aa  249  6e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  37.62 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.84 
 
 		 418 aa  184  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.23 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.15 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.95 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.47 
 
 		 397 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.54 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  37.14 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  34.73 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.97 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  33.51 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.05 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.81 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.73 
 
 		 414 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  33.61 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.61 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.15 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  33.59 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.05 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  35.22 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.42 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  39.42 
 
 		 473 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.79 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.18 
 
 		 399 aa  133  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  34.33 
 
 		 406 aa  133  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.57 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  34.42 
 
 		 396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.11 
 
 		 404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  30 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.69 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.58 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  27.27 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.48 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.47 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  29.02 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.26 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  28.85 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.48 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.61 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  36.92 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  35.21 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.49 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  31.13 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.81 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  32.97 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  34.62 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.4 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.23 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  31.93 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.76 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.12 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.27 
 
 		 417 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  29.5 
 
 		 393 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  39.42 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.61 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  33.9 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.62 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  31.9 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.66 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.83 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.48 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  27.46 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  26.29 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.18 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.81 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  34.39 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  30.51 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  32.95 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  29.3 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  29.3 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  30.56 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.59 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  31.27 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  26.05 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.37 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  28.83 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.65 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.33 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  25.78 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  32.36 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>