More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2491 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  100 
 
 		 396 aa  786    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  34.46 
 
 		 390 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.32 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  31.68 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.03 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  33.33 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.75 
 
 		 408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  33.59 
 
 		 385 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  39.48 
 
 		 401 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.18 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  30.03 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  37.57 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  34.42 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  30.33 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  31.23 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  35.09 
 
 		 382 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.42 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.87 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.96 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.57 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  32.65 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.02 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.94 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.66 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  36.22 
 
 		 429 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.31 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.42 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.73 
 
 		 390 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  29.3 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.5 
 
 		 404 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.9 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.29 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.25 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.81 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 405 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.97 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.75 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.58 
 
 		 401 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.13 
 
 		 385 aa  102  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.53 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.51 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.84 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  32.94 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  27.18 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.15 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  31.37 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.89 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.38 
 
 		 397 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  35.49 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  32.16 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.13 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  31.01 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  28.18 
 
 		 405 aa  97.4  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.13 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.19 
 
 		 389 aa  96.3  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.72 
 
 		 404 aa  96.3  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  32.18 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.62 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  30.75 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  34.38 
 
 		 473 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.84 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.71 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  33.85 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  31.93 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.11 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.79 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.37 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  28.68 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.82 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.73 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  26.85 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.7 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  30.85 
 
 		 336 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.3 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  27.76 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.83 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  26.65 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.94 
 
 		 306 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  26.73 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  29.13 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.76 
 
 		 312 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  25 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  32.26 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  28.43 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  28.51 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  29.88 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  22.69 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.88 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  33.01 
 
 		 401 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.96 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  29.23 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  31.09 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.25 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.67 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  28.35 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  29.98 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.8 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.45 
 
 		 389 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0866  ROK family protein  30.93 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>