More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0646 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  100 
 
 		 438 aa  827    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  50.61 
 
 		 404 aa  326  6e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  41.65 
 
 		 410 aa  269  8.999999999999999e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  47.68 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  47.28 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  42.33 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  40.76 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  35.11 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  40.95 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  39.1 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  45.64 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  45.58 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  35.9 
 
 		 392 aa  183  7e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  38.44 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  42.86 
 
 		 383 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  42.57 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  35.22 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  37.94 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  38.07 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  34.53 
 
 		 403 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  33.57 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  31.47 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  35.25 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.9 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  34.78 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.77 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  34.62 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  34.15 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  33.96 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  34.65 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.97 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  31.67 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.25 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  31.72 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  33.61 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.52 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.42 
 
 		 391 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.86 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.22 
 
 		 398 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.25 
 
 		 398 aa  106  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.28 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.99 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  30.3 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.63 
 
 		 404 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  29.79 
 
 		 404 aa  103  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.47 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  32.13 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  25.7 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  38.65 
 
 		 382 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  29.9 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  33.62 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.4 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.05 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.54 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.06 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  25.99 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.45 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.36 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25 
 
 		 397 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.3 
 
 		 408 aa  96.7  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.63 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.25 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  24.57 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  28.66 
 
 		 396 aa  92.8  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.61 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.65 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.81 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.44 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.43 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.53 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.56 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.02 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.25 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  32.35 
 
 		 390 aa  90.5  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  22.58 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  32.27 
 
 		 367 aa  90.1  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.96 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.46 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.71 
 
 		 422 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.08 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  30.15 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  32.05 
 
 		 332 aa  89.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.24 
 
 		 503 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.59 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  29.71 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 336 aa  87.8  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.22 
 
 		 406 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.34 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.17 
 
 		 405 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  26.74 
 
 		 407 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  32.87 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.28 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.28 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.28 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.28 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.28 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  35.6 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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