More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0891 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  94.47 
 
 		 381 aa  720    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  100 
 
 		 406 aa  808    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  34.36 
 
 		 378 aa  202  7e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  34.62 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  29.97 
 
 		 398 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  26.67 
 
 		 363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.68 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.17 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  26.33 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  22.54 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0957  ROK family protein  29.2 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0976  ROK family protein  29.59 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.95 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  27.16 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  26.02 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  27.41 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  25.06 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  25.57 
 
 		 386 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  25.79 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  26.74 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.57 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  23.92 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  25.54 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  28.07 
 
 		 385 aa  96.3  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  31.53 
 
 		 292 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  23.32 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  27.37 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.52 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.62 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  26.38 
 
 		 448 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  26.74 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  26.89 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  26.19 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  26.76 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  22.39 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  25.44 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  24.41 
 
 		 404 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  24.12 
 
 		 410 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  25.45 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.05 
 
 		 399 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  27.76 
 
 		 292 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  30.36 
 
 		 292 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.47 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  25.87 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  27.22 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  31.7 
 
 		 292 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  30.84 
 
 		 295 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.72 
 
 		 396 aa  90.5  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  26.05 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  25.14 
 
 		 403 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  22.35 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  24.65 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  24.8 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  28.78 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.16 
 
 		 381 aa  89.4  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.4 
 
 		 312 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  33.14 
 
 		 292 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  30.37 
 
 		 295 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.83 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  28.4 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.5 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  31.98 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.48 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  29.44 
 
 		 289 aa  87  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  27.14 
 
 		 404 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.23 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  31.98 
 
 		 292 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  31.98 
 
 		 292 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  31.98 
 
 		 292 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  22.19 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.46 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.19 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  23.42 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  27.17 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.36 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  24.18 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  25.98 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.36 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.43 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.37 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.95 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.84 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  24.07 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  22.73 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.74 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  23.7 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  22.06 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  23.47 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  27.41 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  27.16 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  22.47 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  21.25 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  23.24 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  24.85 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  25.07 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  27.38 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  23.44 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  27.08 
 
 		 298 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  21.92 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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