More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0913 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  100 
 
 		 381 aa  756    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  94.47 
 
 		 406 aa  720    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  34.1 
 
 		 378 aa  205  9e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  34.36 
 
 		 379 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  28.28 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1669  ROK family protein  25.42 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.178321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  26.84 
 
 		 398 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  23.32 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.1 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  26.11 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.41 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.61 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0957  ROK family protein  30.58 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  26.48 
 
 		 417 aa  106  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  24.86 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0976  ROK family protein  30.4 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.46 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  25.56 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.99 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  24.72 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.75 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  24.8 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.01 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  25.79 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  26.55 
 
 		 420 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  27.57 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  26.09 
 
 		 448 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  27.39 
 
 		 385 aa  96.7  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  26.06 
 
 		 367 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  25 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.74 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  26.67 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  22.83 
 
 		 408 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  25.87 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  26.89 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.09 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  25.15 
 
 		 403 aa  94  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  26.41 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  29.91 
 
 		 292 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  26.22 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  23.78 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  24.59 
 
 		 416 aa  92.8  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  24.65 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  22.78 
 
 		 410 aa  92  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  22 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  31.16 
 
 		 292 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  27 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  27.13 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  28.47 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.15 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  23.96 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  26 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  29.11 
 
 		 292 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  25.88 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.89 
 
 		 312 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  23.02 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.85 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  22.84 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.56 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  22.77 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  23.51 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  32.56 
 
 		 292 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.56 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  24.87 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  26.89 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1594  ROK family protein  25.44 
 
 		 368 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00791172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  28.97 
 
 		 295 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  29.83 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  23.76 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  31.98 
 
 		 292 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  22.75 
 
 		 405 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  31.2 
 
 		 289 aa  87.4  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  23.51 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  24.93 
 
 		 393 aa  86.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  28.5 
 
 		 295 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  22.75 
 
 		 434 aa  86.7  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  23.71 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  21.43 
 
 		 399 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.87 
 
 		 383 aa  86.7  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  22.87 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  32 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.02 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1544  ROK family protein  26.07 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.693537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  26.57 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  21.71 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  24.01 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  28.87 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  22.92 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  25.57 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  23.98 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  25.83 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.46 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  23.21 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  23.21 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.97 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  23.21 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  26.67 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  27.06 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.29 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  27.8 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>