More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2589 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2589  ROK  100 
 
 		 389 aa  761    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  39.64 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  33.76 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  35.49 
 
 		 401 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  34.97 
 
 		 401 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  35.83 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  32.28 
 
 		 379 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  34.45 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  32.56 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  32.04 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.18 
 
 		 414 aa  152  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  32.57 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.79 
 
 		 421 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.79 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  30.61 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  31.78 
 
 		 380 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  33.82 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.77 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  29.33 
 
 		 376 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  29.44 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  29.33 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  32.24 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  32.24 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.55 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  30.57 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  31.99 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  31.83 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  31.74 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  31.99 
 
 		 415 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.38 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.38 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.02 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  29.65 
 
 		 410 aa  126  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.58 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  31.91 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  30.31 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  30.57 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  30.58 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  30.41 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.56 
 
 		 393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  29.38 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.9 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  29.19 
 
 		 409 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  30.47 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.51 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  30.85 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  31.12 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  32.43 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  29.05 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.82 
 
 		 396 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  30.6 
 
 		 382 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  30.77 
 
 		 407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  26.87 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  26.87 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 407 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  30.27 
 
 		 407 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.63 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1372  ROK  28.31 
 
 		 398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  29.38 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.46 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  28.72 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  32.48 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  31.06 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.09 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  29.08 
 
 		 421 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  27.25 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.48 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.1 
 
 		 396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.31 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  32.1 
 
 		 754 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  35.2 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.74 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  33.58 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.26 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  30.17 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  29.52 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  31.91 
 
 		 414 aa  109  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.55 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
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NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.6 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.47 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  29.23 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  28.31 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  29.14 
 
 		 381 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
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NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  30.46 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  33.06 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  29.12 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.44 
 
 		 400 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  27.64 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  28.21 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.36 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.67 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.22 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  24.07 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.42 
 
 		 406 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.07 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  29.4 
 
 		 406 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.53 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  36.1 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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