More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0233 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  100 
 
 		 385 aa  759    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  56.66 
 
 		 385 aa  358  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  44.56 
 
 		 383 aa  285  8e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  46.15 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  48.76 
 
 		 374 aa  259  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  35.68 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  35.83 
 
 		 386 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  35.53 
 
 		 408 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  34.49 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  28.42 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  31.68 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  34.57 
 
 		 395 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  36.02 
 
 		 401 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.95 
 
 		 418 aa  136  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.53 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  35.27 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.42 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.45 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  36.04 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  33.01 
 
 		 402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.15 
 
 		 389 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.86 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.82 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  36.94 
 
 		 406 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  27.64 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.27 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.09 
 
 		 414 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  37.27 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.66 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.74 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  34.16 
 
 		 391 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.33 
 
 		 387 aa  119  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  30.86 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  35.69 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  30.43 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.01 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  35.34 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.76 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.96 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.88 
 
 		 408 aa  116  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.53 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.97 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.9 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.85 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.91 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.21 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.04 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.33 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.42 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.95 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  36.92 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.4 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  28.62 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.23 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.85 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.9 
 
 		 404 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.4 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.57 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.28 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.2 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.33 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.8 
 
 		 434 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  35.4 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  33.46 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  34.46 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  25.34 
 
 		 407 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  30.77 
 
 		 395 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  33.58 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  27.78 
 
 		 391 aa  109  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.72 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  32.45 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  31.55 
 
 		 403 aa  109  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.55 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  25.6 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.24 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.24 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  31.94 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 405 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  31.34 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  35.02 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.48 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  33.06 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  31.76 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  31.87 
 
 		 392 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.83 
 
 		 435 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  24.75 
 
 		 399 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.19 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  35.88 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.26 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.47 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.45 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.41 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  31.51 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.17 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  33.23 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  30.77 
 
 		 404 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.72 
 
 		 390 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  30.77 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  33.42 
 
 		 413 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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