More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0390 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  100 
 
 		 404 aa  818    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.43 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  30.03 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.81 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.89 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  30.89 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  32.08 
 
 		 410 aa  180  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  29.84 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.95 
 
 		 391 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.59 
 
 		 395 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.73 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  30.19 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  32.3 
 
 		 385 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.42 
 
 		 389 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  27.42 
 
 		 404 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.25 
 
 		 410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.27 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  34.83 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.42 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.9 
 
 		 408 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.18 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.1 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.67 
 
 		 404 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  30.35 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.16 
 
 		 408 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.33 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.85 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  28.39 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.53 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.55 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.84 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.69 
 
 		 316 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  33.97 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.06 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  152  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.65 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.63 
 
 		 395 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.29 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.15 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  27.42 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.81 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.72 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.08 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  31.43 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.74 
 
 		 312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.61 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  26.77 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.69 
 
 		 397 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.82 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.07 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  24.87 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.13 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.44 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.1 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.44 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  27.65 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  30.03 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.1 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  30.16 
 
 		 318 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  29.71 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  30.6 
 
 		 352 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 405 aa  142  8e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  25.98 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.06 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.77 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  27.6 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  33.81 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.34 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  30.39 
 
 		 317 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  29.18 
 
 		 316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.34 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.34 
 
 		 315 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  33.02 
 
 		 313 aa  140  6e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  25.73 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.92 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  25.73 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  25.73 
 
 		 408 aa  139  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  24.8 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>