More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3041 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  100 
 
 		 410 aa  846    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  46.13 
 
 		 407 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  32.63 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  32.02 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  30.53 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  30.37 
 
 		 408 aa  200  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  31.07 
 
 		 407 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  30.86 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  31.07 
 
 		 407 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  30.21 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.18 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  30.27 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  29.91 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  29.91 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  29.91 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  29.91 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  29.91 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  27.61 
 
 		 406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.2 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.19 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  28.19 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.46 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.19 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  29 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.38 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.89 
 
 		 404 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.08 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.22 
 
 		 405 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  27.08 
 
 		 404 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.46 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.46 
 
 		 396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.49 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  27.56 
 
 		 406 aa  161  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  27.56 
 
 		 406 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  26.98 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  27.56 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  26.98 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  26.98 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  26.98 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  26.98 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  27.59 
 
 		 407 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  26.98 
 
 		 406 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.6 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.33 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  27.13 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  26.86 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  26.86 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  26.86 
 
 		 406 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  26.86 
 
 		 406 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.95 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  27.73 
 
 		 405 aa  149  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  26.71 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.08 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  27.47 
 
 		 405 aa  146  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  26.26 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  27.45 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.89 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  27.45 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  28.01 
 
 		 405 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.9 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.99 
 
 		 399 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.93 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.93 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.1 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.42 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.54 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  26.19 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.87 
 
 		 408 aa  140  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  26.63 
 
 		 422 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.54 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.49 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.66 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  26.16 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.15 
 
 		 386 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.34 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.58 
 
 		 317 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.17 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.3 
 
 		 401 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.26 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  27.3 
 
 		 392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.28 
 
 		 414 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.96 
 
 		 364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  26.1 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.32 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  30.8 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.63 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.47 
 
 		 323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.96 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.97 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.48 
 
 		 395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  25.53 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>