More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1506 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  100 
 
 		 390 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  70.1 
 
 		 389 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  55.05 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  43.15 
 
 		 395 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  44.53 
 
 		 401 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  41.19 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  40.78 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  41.45 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  40.5 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  42.57 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  41.27 
 
 		 413 aa  219  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  40.55 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  37.88 
 
 		 404 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  40.9 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  34.21 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  32.98 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.81 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.47 
 
 		 397 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  33.68 
 
 		 417 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.83 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3083  ROK family protein  33.51 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.048241  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.42 
 
 		 382 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.57 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.59 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  34.29 
 
 		 457 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  32.4 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  37.99 
 
 		 406 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.56 
 
 		 400 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  28.96 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  37.72 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1123  ROK family protein  44.02 
 
 		 836 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210366  normal  0.224116 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  31.97 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  33.25 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.85 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  28.27 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.73 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.43 
 
 		 402 aa  139  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.42 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.2 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.57 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  33.25 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.97 
 
 		 389 aa  136  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  31.16 
 
 		 403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25.07 
 
 		 434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  32.53 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.2 
 
 		 390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  32.14 
 
 		 385 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  32.73 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  31.19 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.54 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  28.19 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  32.08 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  35.42 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.63 
 
 		 399 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.69 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.97 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  34.36 
 
 		 410 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.74 
 
 		 342 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  32.75 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.17 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.78 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  31.47 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.54 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3308  ROK family protein  30.13 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.18437  normal  0.715302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.42 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.16 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.86 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  29.01 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  32.74 
 
 		 401 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.87 
 
 		 386 aa  126  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.53 
 
 		 503 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.16 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.62 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  31.79 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.73 
 
 		 403 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.07 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  35.01 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.55 
 
 		 401 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.13 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.5 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.14 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 405 aa  123  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  31.85 
 
 		 396 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  31.52 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.71 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.96 
 
 		 408 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  34.9 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.94 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.82 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  32.32 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  35.66 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.48 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  26.42 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  33.51 
 
 		 385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.75 
 
 		 317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.57 
 
 		 401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 		 395 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.11 
 
 		 407 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  31.7 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>