More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 406 aa  775    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  50.12 
 
 		 410 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  53 
 
 		 403 aa  342  7e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  49.87 
 
 		 404 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  46.29 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  43.22 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  36.61 
 
 		 409 aa  230  4e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  40.3 
 
 		 413 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  42.2 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  41.18 
 
 		 409 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  41.38 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  38.56 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  46.61 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  36.82 
 
 		 417 aa  176  6e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  44.4 
 
 		 473 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  37.35 
 
 		 457 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  33.78 
 
 		 392 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.02 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  38.07 
 
 		 409 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  36.64 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  38.18 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  37.57 
 
 		 401 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.28 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.71 
 
 		 389 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.84 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  32.14 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.42 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  32.03 
 
 		 436 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  31.68 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  33.33 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.56 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  34.43 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  32.34 
 
 		 408 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.69 
 
 		 386 aa  126  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.4 
 
 		 404 aa  126  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.17 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.84 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.38 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.22 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  30.45 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.92 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.23 
 
 		 434 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.53 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.61 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.2 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  30.86 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.75 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.52 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  27.54 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.05 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  31.93 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.78 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.47 
 
 		 418 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.88 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  30.37 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  32.98 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  33.42 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.49 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.9 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.91 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.13 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.39 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.51 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.06 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  32.38 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  32.2 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  31.77 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.16 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.92 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  30.37 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.27 
 
 		 428 aa  116  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  31.33 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  34.2 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.23 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.91 
 
 		 401 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.63 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.33 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  32.58 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  37.12 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.17 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  24.94 
 
 		 404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  23.42 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  31.61 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  32.8 
 
 		 390 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.98 
 
 		 406 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  34.84 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.7 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  21.95 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.14 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.09 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  35.4 
 
 		 390 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  31.22 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>