More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6688 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  100 
 
 		 406 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  43.43 
 
 		 404 aa  260  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  45.01 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  38.46 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  42.79 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  43.97 
 
 		 413 aa  236  8e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  42.2 
 
 		 406 aa  225  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  44.19 
 
 		 391 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  47.48 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  40.14 
 
 		 438 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  42.57 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  38.27 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  34.73 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  40.33 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  37.78 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  35.71 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  38.39 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.75 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  32.45 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  33.59 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  35.94 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  36.61 
 
 		 401 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  37.94 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.66 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  34.48 
 
 		 457 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  39.23 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  37.54 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.51 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  34.2 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  32.73 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  35.9 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  36.05 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  31.62 
 
 		 436 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.52 
 
 		 390 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  35.47 
 
 		 390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.59 
 
 		 405 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.58 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.77 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  33.14 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  25.94 
 
 		 416 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  33.5 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  31.14 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.53 
 
 		 386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  35.21 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  34.96 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  30.27 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  34.02 
 
 		 405 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  32.35 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  33.04 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  30.74 
 
 		 364 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.09 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  34.02 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.37 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  31.91 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.74 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  36.48 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  32.96 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.33 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  39.06 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.578503 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.53 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.68 
 
 		 396 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  34.19 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.29 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  31.67 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  34.11 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  32.36 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  32.59 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  30.7 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.67 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  37.93 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  28.35 
 
 		 396 aa  107  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.47 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  26.1 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.94 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  32.94 
 
 		 390 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.9 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.22 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  30.65 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.21 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.43 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  30.42 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.31 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.96 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.28 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  34.4 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  32.77 
 
 		 402 aa  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  25 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  22.93 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1189  ROK family protein  33.08 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.708792  normal  0.0977285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  24.68 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  24.68 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  24.68 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.81 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.58 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  30.74 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.78 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.69 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  30.28 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>