More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4488 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  100 
 
 		 374 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  55.38 
 
 		 383 aa  361  9e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  50.54 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  48.76 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  49.46 
 
 		 385 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  36.03 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 374 aa  199  9e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  33.33 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  34.61 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.81 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  36.05 
 
 		 418 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  29.08 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.91 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.65 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.36 
 
 		 387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.73 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  38.15 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.74 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.87 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  31.73 
 
 		 410 aa  144  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  35.97 
 
 		 389 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  34.47 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.87 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.14 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  37.57 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  37.73 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.86 
 
 		 383 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  34.11 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.21 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.93 
 
 		 385 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  30.2 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  26.49 
 
 		 390 aa  135  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  34.55 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.94 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  38.55 
 
 		 473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  34.95 
 
 		 417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.2 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  31.77 
 
 		 402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.7 
 
 		 392 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.35 
 
 		 405 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  33.85 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.2 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  30.15 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.75 
 
 		 404 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  32.84 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  33.06 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.85 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.84 
 
 		 396 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  35.79 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.2 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  38.81 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.42 
 
 		 378 aa  129  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.06 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  35.62 
 
 		 397 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  33.07 
 
 		 400 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  34.63 
 
 		 436 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  33.7 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.95 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.79 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.36 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.63 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  32.89 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  32.71 
 
 		 410 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  34.11 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.01 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.54 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.66 
 
 		 323 aa  126  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  35.54 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.1 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.6 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  32.72 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  35.54 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.23 
 
 		 401 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.88 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.24 
 
 		 417 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.72 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  34.65 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  32.71 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  30.47 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.57 
 
 		 391 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.95 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.52 
 
 		 381 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  31.15 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  35.32 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  34.75 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.07 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.83 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  31.12 
 
 		 400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.14 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.79 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.46 
 
 		 503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  36.53 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  33.12 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  37.82 
 
 		 406 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.12 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  36.1 
 
 		 393 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  32.97 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.36 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.83 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
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