More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 392 aa  761    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  38.78 
 
 		 404 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  35.66 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  35.73 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3308  ROK family protein  40.11 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0139396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  33.5 
 
 		 406 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4664  ROK family protein  36.25 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213413  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  33.08 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0646  ROK family protein  35.38 
 
 		 438 aa  170  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0223419  hitchhiker  0.00474804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  36.08 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  33.75 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  36.51 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  42.07 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  35.52 
 
 		 391 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  35.71 
 
 		 406 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  38.44 
 
 		 404 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.03 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2986  ROK family protein  39.3 
 
 		 398 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.19 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.5 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  35.7 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  35.68 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  35.05 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  36.13 
 
 		 401 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  40.07 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.65 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7617  transcriptional regulator, ROK family  33.25 
 
 		 408 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.451753  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.73 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  33 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.92 
 
 		 401 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.11 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  33.24 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  35.16 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  25.73 
 
 		 398 aa  131  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.07 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  34.22 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  33.93 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.86 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.33 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.53 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.45 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  28.29 
 
 		 390 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  30.91 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  26.32 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.53 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.45 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  30.58 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  28.99 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  34.38 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.67 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.61 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  31.3 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  35.16 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.37 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.88 
 
 		 396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5946  ROK family protein  29.85 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.908629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.13 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  34.43 
 
 		 418 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.31 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.27 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.97 
 
 		 386 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1506  ROK family protein  33.68 
 
 		 390 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.809262  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  31.97 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  31.27 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.53 
 
 		 409 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  31.27 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.53 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  31.35 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  32.57 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.65 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.19 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.51 
 
 		 387 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.46 
 
 		 434 aa  112  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.68 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  32.65 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  32.11 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2174  ROK family protein  35.13 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000419301 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  31.76 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.94 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.23 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.53 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 405 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.69 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  27.61 
 
 		 399 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  28.9 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
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NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.13 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.15 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  27.76 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.4 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  25.38 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  29.52 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  31.19 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  36.36 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  30.25 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
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NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.68 
 
 		 402 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  31.74 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.2 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  31.41 
 
 		 400 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  31.87 
 
 		 385 aa  106  8e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.55 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
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