More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0705 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0705  ROK family protein  100 
 
 		 374 aa  730    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0694  ROK family protein  50.42 
 
 		 382 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.04 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  35.88 
 
 		 387 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.12 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  30.81 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.31 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  36.18 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.6 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  28.27 
 
 		 378 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.23 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  33.13 
 
 		 396 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.23 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  32.05 
 
 		 417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  35.11 
 
 		 473 aa  133  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.12 
 
 		 408 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  34.19 
 
 		 448 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.08 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  37.3 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.38 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.27 
 
 		 400 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.15 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.66 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.2 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6204  ROK family protein  32.31 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4488  ROK family protein  33.52 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.520196  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.91 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  32.19 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.46 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.34 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6688  ROK family protein  35.34 
 
 		 406 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.395851 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.13 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.3 
 
 		 396 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  34.63 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.69 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.67 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.56 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.53 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.17 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2826  ROK family protein  35.25 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  30.42 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  36.59 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.54 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.57 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.48 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.75 
 
 		 409 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  31.27 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.21 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  30.83 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.42 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  31.43 
 
 		 397 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  30.77 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0826731 
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.09 
 
 		 402 aa  115  8.999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  27.93 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2491  ROK family protein  27.18 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.831106  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  32.17 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.1 
 
 		 396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  25.81 
 
 		 401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.59 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.88 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.1 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  25.51 
 
 		 407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  29.11 
 
 		 382 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  24.48 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  25.39 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.01 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06180  transcriptional regulator/sugar kinase  33.81 
 
 		 406 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  28.68 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.35 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.1 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.19 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  30.19 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  33.52 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0731  ROK family protein  21.15 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  34.96 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0465  ROK family protein  30.47 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  27.01 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  27.16 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  32.47 
 
 		 404 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  32 
 
 		 392 aa  110  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.62 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.77 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2429  ROK family protein  32.55 
 
 		 418 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  29.5 
 
 		 402 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.06 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  38.25 
 
 		 318 aa  109  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.95 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  26.9 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  23.54 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.11 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.52 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  30.95 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.68 
 
 		 393 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  30.26 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  34.59 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  27.06 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
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NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  24.29 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.39 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.53 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.7 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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