More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  100 
 
 		 406 aa  789    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  53.26 
 
 		 407 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  52.48 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  52.5 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  48.57 
 
 		 409 aa  358  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  47.56 
 
 		 398 aa  358  9e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  50 
 
 		 415 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  49.08 
 
 		 409 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  49.34 
 
 		 415 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  49.23 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  46.21 
 
 		 413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  48.36 
 
 		 411 aa  324  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  46.3 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  39.46 
 
 		 390 aa  293  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  43.86 
 
 		 416 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  40.55 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  40.76 
 
 		 414 aa  250  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  38.94 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  40.25 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  42.56 
 
 		 413 aa  239  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  42.04 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  39.09 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  37.24 
 
 		 410 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  39.95 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  35.14 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  35.14 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  34.97 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  35.23 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  35.23 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  35.4 
 
 		 416 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  34.97 
 
 		 415 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  35.23 
 
 		 415 aa  189  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  35.48 
 
 		 415 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  35.66 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  32.31 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  35.71 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.56 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  28.79 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.22 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  32.56 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  30.05 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.23 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  31.77 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  29.47 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.7 
 
 		 421 aa  126  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.18 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  29.67 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  28.71 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  29.89 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  28.53 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  28.53 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  27.05 
 
 		 382 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.72 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  29.57 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.1 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.5 
 
 		 379 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.4 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.86 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.25 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.38 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.15 
 
 		 389 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  25.47 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  25.2 
 
 		 376 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  32.26 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.09 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.73 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  29.45 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  24 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.64 
 
 		 401 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.98 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  36.15 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.86 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.11 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.94 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  29.2 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  30.04 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.39 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  28.22 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.62 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  30.04 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.14 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.23 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.06 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  32.4 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.57 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  28.18 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  31.25 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  31.98 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.5 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.44 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.79 
 
 		 395 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  31.6 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.56 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.57 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.32 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  32.77 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>