More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0928 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0928  ROK family protein  100 
 
 		 329 aa  656    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.400197 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06730  transcriptional regulator/sugar kinase  43.47 
 
 		 341 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0495278  normal  0.905814 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  43.63 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08320  transcriptional regulator/sugar kinase  43.38 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.416442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3392  ROK family protein  37.5 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0183  ROK family protein  38.12 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3770  ROK family protein  38.13 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  47.26 
 
 		 363 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  32.72 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.69 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2121  ROK family protein  38.51 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  29.55 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.01 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  31.17 
 
 		 314 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.45 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  30.99 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.3 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.07 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.07 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  30.38 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.97 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.87 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.9 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.25 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  31.99 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.74 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  27.96 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  29.22 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.28 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  28.78 
 
 		 443 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.21 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  26.38 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  31.51 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  29.72 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  34.49 
 
 		 317 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.97 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  32.59 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  27.92 
 
 		 313 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  26.06 
 
 		 295 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.85 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  26.97 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  27.8 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.83 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.09 
 
 		 422 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  29.02 
 
 		 312 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28 
 
 		 408 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  30.99 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.13 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  27.76 
 
 		 404 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  31.43 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  31.43 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  29.03 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  29.81 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0040  ROK family protein  26.62 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.68 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  31.5 
 
 		 313 aa  99.4  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  30.45 
 
 		 340 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  30 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  32.47 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.17 
 
 		 390 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  26.43 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.65 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.5 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2139  ROK family protein  31.83 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.06 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.03 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  27.56 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2487  ROK family protein  29.28 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  28.36 
 
 		 283 aa  97.1  4e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  31.21 
 
 		 420 aa  96.3  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  34.63 
 
 		 395 aa  96.3  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.65 
 
 		 312 aa  96.3  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  30 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  28.68 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  31.72 
 
 		 302 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  28.48 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  30.19 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.73 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.76 
 
 		 409 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  31.21 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0003  glucokinase  36.48 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000615827  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  28.99 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.29 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.62 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.88 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  31.48 
 
 		 313 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.99 
 
 		 402 aa  94  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1371  glucokinase  29.35 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  30.13 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  30.45 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  31.03 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  28.97 
 
 		 406 aa  93.2  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>