More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5819 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  100 
 
 		 398 aa  768    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  50.25 
 
 		 393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  45.11 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  44.53 
 
 		 391 aa  256  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  44.44 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  43.86 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  40.62 
 
 		 404 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  43.61 
 
 		 392 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  39.9 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  38.64 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  35.26 
 
 		 417 aa  189  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  35.24 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  38.73 
 
 		 398 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.25 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  35 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.52 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  31.42 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  30.1 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  31.3 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.25 
 
 		 401 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  30 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  33.5 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  30.03 
 
 		 387 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.44 
 
 		 380 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.34 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.28 
 
 		 401 aa  109  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  29.6 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.65 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.68 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  31.37 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  26.01 
 
 		 381 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  35.8 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.57 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.08 
 
 		 418 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.07 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35 
 
 		 408 aa  96.7  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.42 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.53 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29.34 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.14 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.51 
 
 		 387 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  27.92 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.19 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  30.58 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  30.89 
 
 		 377 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.31 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  29.02 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.41 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.83 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.98 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.06 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.62 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  28.93 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.63 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.38 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.08 
 
 		 390 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  30.36 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  33.78 
 
 		 428 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.15 
 
 		 389 aa  90.5  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  28.62 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.28 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  30.91 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.1 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.23 
 
 		 396 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  26.7 
 
 		 398 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.23 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  31.62 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.36 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  30 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.38 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  30.41 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  31.28 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  27.7 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.86 
 
 		 378 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.41 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.31 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.74 
 
 		 397 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  20.81 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  27.1 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  23 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.01 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  29.44 
 
 		 386 aa  86.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  33.88 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  29.59 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.78 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.57 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  27.81 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.48 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.55 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  24.56 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  24.52 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.16 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  27.49 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  27.31 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  28.9 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.45 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  27.51 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  29.39 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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