More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0090 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  98.94 
 
 		 382 aa  742    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  100 
 
 		 377 aa  748    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  61.29 
 
 		 374 aa  437  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  41.78 
 
 		 379 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  33.6 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  31.64 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.62 
 
 		 399 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.1 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  27.44 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.57 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.63 
 
 		 408 aa  102  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  27.18 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  31.01 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.69 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.58 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  28.53 
 
 		 392 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.61 
 
 		 401 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  25.95 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  27.08 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.26 
 
 		 404 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  28.85 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.01 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  27.58 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  30.56 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  23.98 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.39 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  28.68 
 
 		 418 aa  94  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  25.73 
 
 		 407 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.65 
 
 		 406 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  27.72 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  26.88 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.27 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  26.34 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.33 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.82 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.77 
 
 		 400 aa  89.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.95 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  28.73 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  28.96 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.07 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  28.79 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.23 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  22.39 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.47 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  29.24 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  28.09 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.44 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  28.88 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  27.63 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.65 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.79 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  28.26 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  27.44 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  30.29 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  23.78 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.49 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.76 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  22.25 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.5 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.43 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  24.42 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.76 
 
 		 503 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.17 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  23.98 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  33.47 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  29.67 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  30.93 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.86 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  27.44 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  25.36 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  32.99 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  24.3 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  26.8 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  26.37 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.19 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  23.82 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  29.41 
 
 		 367 aa  79.7  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  25.07 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  23.28 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  25.8 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  30.3 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.53 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  26.74 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  23.17 
 
 		 407 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  30.05 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  22.69 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>