More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7907 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Replicon accession
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% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  100 
 
 		 398 aa  778    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  52.93 
 
 		 380 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  41 
 
 		 391 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  38.79 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  36.22 
 
 		 388 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  37.91 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  34.88 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  35.05 
 
 		 406 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  33.15 
 
 		 399 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.47 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  31.85 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.5 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  30.79 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  30.94 
 
 		 392 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.26 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.24 
 
 		 406 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.59 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.83 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.05 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.34 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  28.87 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  28.72 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  30.41 
 
 		 420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.82 
 
 		 388 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.47 
 
 		 391 aa  110  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.92 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  32.68 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.42 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  31.58 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  30 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  30.28 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.47 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.75 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  28.31 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.08 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  28.82 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  30.5 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.41 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.42 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.96 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  33.33 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  29.24 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  22.82 
 
 		 391 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.32 
 
 		 418 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  30.85 
 
 		 392 aa  99.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  28.82 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  22.71 
 
 		 396 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  33.91 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  26.98 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.68 
 
 		 387 aa  97.4  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.27 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.8 
 
 		 389 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.55 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.09 
 
 		 754 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  27.8 
 
 		 336 aa  97.1  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  28.88 
 
 		 404 aa  97.1  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  30.09 
 
 		 379 aa  97.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.83 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  27.6 
 
 		 300 aa  96.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.54 
 
 		 312 aa  96.3  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  29.44 
 
 		 376 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  25.6 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.46 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.91 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  29.4 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  22.49 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  29.07 
 
 		 503 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  31.39 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.21 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  30.89 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28 
 
 		 313 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  28.1 
 
 		 399 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  24.69 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  24.69 
 
 		 315 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  27.6 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.53 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  29 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  23.27 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.56 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  28.2 
 
 		 315 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  24.81 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  27.99 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  31.09 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  23.97 
 
 		 317 aa  91.3  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  29.71 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.87 
 
 		 401 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.61 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.11 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.54 
 
 		 391 aa  89.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  22.16 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  27.7 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.93 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.24 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.83 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  30.74 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  27.86 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  28.53 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  26.69 
 
 		 318 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  29.22 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
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