More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1932 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  100 
 
 		 390 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  52.67 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  55.81 
 
 		 391 aa  362  6e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  53.94 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  55.04 
 
 		 391 aa  359  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  48.37 
 
 		 404 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  50.64 
 
 		 386 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  42.78 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  36.6 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  38.15 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  38.73 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  36.84 
 
 		 380 aa  209  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.61 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  36.04 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  34.82 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  31.51 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.4 
 
 		 393 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  31.98 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  33.8 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.51 
 
 		 389 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.81 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.23 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.14 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  33.8 
 
 		 418 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  29.38 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  28.68 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  30.38 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  33.04 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.5 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  34.29 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.59 
 
 		 388 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  32.81 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  27.03 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.55 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  31.09 
 
 		 403 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.59 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.02 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  31.68 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  23.83 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.43 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.09 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  32.04 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  23.67 
 
 		 406 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  29.18 
 
 		 403 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.62 
 
 		 404 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.22 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.13 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.11 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.11 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.11 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.11 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.11 
 
 		 406 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  26.98 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  31.27 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.81 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.75 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.66 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.44 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  30.06 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  24.34 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.25 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.25 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  24.48 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  30.95 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  30.61 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.97 
 
 		 389 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.49 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  22.64 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.33 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.53 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  26.06 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  24.7 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.14 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.27 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.03 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  33.03 
 
 		 393 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.85 
 
 		 378 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  27.33 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.01 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  33.61 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.83 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  34.43 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.58 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  28.94 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.91 
 
 		 403 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  23.1 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  25.87 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.71 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  28.03 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.3 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.82 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  30.09 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>