More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0660 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  100 
 
 		 404 aa  783    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  55.86 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  58.96 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  59.41 
 
 		 386 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  52.85 
 
 		 391 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  48.37 
 
 		 390 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  51.99 
 
 		 391 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  43.21 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  40.62 
 
 		 398 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  33.66 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  36.92 
 
 		 380 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  38.46 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  32.67 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  35.98 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  35.31 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.75 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  31.54 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  29.07 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  29.07 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.87 
 
 		 414 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.74 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.78 
 
 		 404 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  30.45 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.94 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  29.55 
 
 		 400 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  28.46 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.67 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.48 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.63 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.12 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  26 
 
 		 410 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.62 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  24.5 
 
 		 387 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.48 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.75 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.75 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.75 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.75 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.75 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  31.2 
 
 		 389 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  22.52 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.37 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  24.63 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  32.48 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.66 
 
 		 403 aa  97.1  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.46 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.32 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  26.03 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  27.97 
 
 		 399 aa  94.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  26.97 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.77 
 
 		 396 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  27.78 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.23 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29.08 
 
 		 391 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.08 
 
 		 391 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  32.98 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.25 
 
 		 396 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  26.17 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  26.8 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04820  transcriptional regulator/sugar kinase  30.11 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  22.97 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.25 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.77 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  24.16 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.81 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  29.82 
 
 		 342 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  28.01 
 
 		 373 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  24.4 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  32.38 
 
 		 415 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  27.2 
 
 		 401 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.77 
 
 		 416 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.44 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  27.91 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.43 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.43 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  31.5 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.2 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  30 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24610  transcriptional regulator/sugar kinase  30.88 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  23.82 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  33.33 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.21 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  29.83 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.53 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  28.38 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  31.4 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.87 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.96 
 
 		 384 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  25.21 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  22.42 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.09 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>