More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5256 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  100 
 
 		 415 aa  814    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  55.04 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  37.66 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  39.63 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  33.92 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  33.92 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  34.14 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  30.99 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  33.51 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  34.38 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.84 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  33 
 
 		 410 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  32.99 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  33.06 
 
 		 403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  31.22 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.51 
 
 		 387 aa  122  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.69 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.3 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  29.92 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  31.3 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.14 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.15 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  31.69 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.82 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  29.02 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  33.33 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.52 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.3 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  31.55 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  32.78 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  31.78 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.03 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31.08 
 
 		 408 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  36.54 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.31 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  35.06 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.2 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.02 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  38.2 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.43 
 
 		 410 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.77 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0678  ROK family protein  33.44 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0268502  hitchhiker  0.00659197 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  28.92 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  30.33 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.74 
 
 		 381 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  33.05 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  32.5 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.74 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.47 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  35.81 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.28 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  27.22 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.45 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.56 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  31.14 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.97 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.5 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  32.53 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0099  ROK family protein  31.37 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.76 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.18 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  29.46 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  25.71 
 
 		 402 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  29.81 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.88 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  28.88 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30.2 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.2 
 
 		 390 aa  99.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  24.65 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  33.63 
 
 		 372 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.84 
 
 		 319 aa  98.6  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  21.21 
 
 		 408 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.6 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  29.61 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.97 
 
 		 408 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.14 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.77 
 
 		 403 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  34.08 
 
 		 385 aa  96.3  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  27.58 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01680  transcriptional regulator/sugar kinase  30.99 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.77 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  24.64 
 
 		 292 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.24 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  26.07 
 
 		 292 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  26.23 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.91 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.13 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  28.91 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  33.65 
 
 		 315 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  25.36 
 
 		 292 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  32.92 
 
 		 255 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  29.78 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.53 
 
 		 389 aa  94.7  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  25.26 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  28.35 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  28.21 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  28.08 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.88 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.72 
 
 		 292 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.57 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>