More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0868 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  100 
 
 		 400 aa  794    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  34.64 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  34 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  34.71 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  32.07 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  36.42 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  35.22 
 
 		 399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  34.59 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  32.62 
 
 		 392 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.17 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  35.06 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  29.89 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  28.65 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  30.13 
 
 		 391 aa  126  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.91 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  33.6 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  33.6 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  34.14 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  31.29 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  31.93 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  30 
 
 		 391 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  33.06 
 
 		 391 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  31 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  30.49 
 
 		 332 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.06 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  30.13 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.31 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.53 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  29.55 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  28.3 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  25.38 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.23 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  27.85 
 
 		 320 aa  106  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.8 
 
 		 381 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  25.62 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.7 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  24.61 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  29.68 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.46 
 
 		 503 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  30.89 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  29.38 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.23 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  30.03 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.94 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.7 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  31.04 
 
 		 428 aa  100  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  28.53 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  27.51 
 
 		 372 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.05 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  26.44 
 
 		 292 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.11 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  24.66 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.93 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.64 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  28.7 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.15 
 
 		 315 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.15 
 
 		 315 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.7 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  27.66 
 
 		 405 aa  96.3  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.86 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  27.58 
 
 		 455 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.06 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  28.79 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  26.91 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  24.93 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  25.75 
 
 		 292 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  25.34 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  25.34 
 
 		 292 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.85 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  25.34 
 
 		 292 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  25 
 
 		 292 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.88 
 
 		 389 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.7 
 
 		 418 aa  92.8  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  25.08 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  21.22 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  29.27 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.11 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  30.56 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  26.54 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.44 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  25.49 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  27.76 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.01 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  30.56 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  27.65 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  23.77 
 
 		 323 aa  88.6  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  25.48 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.61 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>