More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2018 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  100 
 
 
391 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  55.04 
 
 
415 aa  347  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.85 
 
 
420 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  35.47 
 
 
399 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  33.24 
 
 
393 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  32.43 
 
 
393 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  31.4 
 
 
393 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  32.61 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  29.19 
 
 
396 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  31.17 
 
 
400 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.65 
 
 
401 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.84 
 
 
388 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  30.46 
 
 
386 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.05 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.19 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.34 
 
 
400 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  30.3 
 
 
392 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.38 
 
 
387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  32.89 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.18 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  30.08 
 
 
387 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.1 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.46 
 
 
387 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29.55 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.92 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.26 
 
 
380 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  29.26 
 
 
393 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  31.01 
 
 
373 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  31.97 
 
 
404 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  29.19 
 
 
399 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  29.26 
 
 
404 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.81 
 
 
414 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.24 
 
 
395 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  29.59 
 
 
392 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  27.84 
 
 
391 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  27.88 
 
 
391 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  31.97 
 
 
406 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.27 
 
 
400 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.89 
 
 
398 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.21 
 
 
402 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.37 
 
 
410 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.6 
 
 
383 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  27.86 
 
 
400 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  29.25 
 
 
410 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  30.41 
 
 
372 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.1 
 
 
406 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  30 
 
 
374 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.63 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.3 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  22.25 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  25.42 
 
 
292 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.74 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  26.63 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.62 
 
 
300 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.57 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  29.37 
 
 
392 aa  96.3  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  29.9 
 
 
317 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0372  ROK family protein; glucokinase  26.19 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.45 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  25.85 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  25.85 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.39 
 
 
420 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0207  NagC family transcriptional regulator  33.86 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.602966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  25.85 
 
 
292 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  25.85 
 
 
292 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  25.55 
 
 
395 aa  94  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.29 
 
 
395 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  36.41 
 
 
383 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.67 
 
 
405 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.08 
 
 
409 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  25.85 
 
 
292 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0562  ROK family protein  28.69 
 
 
312 aa  93.2  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  24.15 
 
 
292 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  29.38 
 
 
414 aa  92.8  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.55 
 
 
386 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  31.71 
 
 
323 aa  92.8  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  25.78 
 
 
391 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  24.83 
 
 
292 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.82 
 
 
396 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0463  ROK family protein  25.51 
 
 
292 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.59 
 
 
389 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.93 
 
 
503 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.37 
 
 
319 aa  90.1  6e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  21.52 
 
 
385 aa  89  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.05 
 
 
323 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.87 
 
 
328 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.79 
 
 
303 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  27.79 
 
 
393 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  28.07 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.77 
 
 
312 aa  86.7  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  27.27 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  28.29 
 
 
402 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  32.39 
 
 
332 aa  86.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.21 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  22.65 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  27.99 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  25.32 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.72 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  25.13 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  27.78 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
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