More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7348 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  100 
 
 		 393 aa  760    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  50.25 
 
 		 398 aa  323  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  45.92 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  46.51 
 
 		 386 aa  279  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  48.57 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  47.41 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  43.21 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  46.8 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  42.78 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  41.04 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  36.56 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  33.16 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  38.28 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  36.76 
 
 		 420 aa  182  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  36.5 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  31.79 
 
 		 396 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  32.74 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.93 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  32.21 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.97 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  33.51 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  31.55 
 
 		 403 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.09 
 
 		 396 aa  119  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.18 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.41 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.46 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  29.68 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  29.29 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  31.05 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.43 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.44 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.57 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.97 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.36 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.19 
 
 		 380 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.65 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.45 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.19 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  31.39 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
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NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.19 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  29.62 
 
 		 400 aa  103  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  29.18 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.09 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.95 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.93 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  34.6 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  31.18 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.72 
 
 		 399 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  33.62 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  32.37 
 
 		 503 aa  99.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.68 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  26.76 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.79 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  28.46 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  29.77 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  30.47 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.14 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.8 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  25.56 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.81 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.9 
 
 		 396 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.61 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  33.52 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.57 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  35.29 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  32.1 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  25.77 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.06 
 
 		 409 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  30.28 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  30.17 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.31 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  22.96 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  30.36 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  29.89 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  29.89 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  29.89 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  28.94 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  30.65 
 
 		 332 aa  91.3  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.61 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.14 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.34 
 
 		 403 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  29.61 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  34.25 
 
 		 418 aa  89.7  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.5 
 
 		 428 aa  89.7  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  28.9 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.11 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.71 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.73 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  26.8 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  28.85 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  28.96 
 
 		 367 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  33.33 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  29.05 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.99 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.33 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.86 
 
 		 393 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.72 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  29.66 
 
 		 403 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  30.23 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  28.98 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
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