More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1466 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 416 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  95.9 
 
 		 415 aa  774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  81.73 
 
 		 416 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  96.39 
 
 		 415 aa  776    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  99.52 
 
 		 415 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  96.39 
 
 		 415 aa  776    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  80.77 
 
 		 416 aa  663    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  81.01 
 
 		 416 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  95.19 
 
 		 416 aa  763    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  100 
 
 		 415 aa  822    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  96.14 
 
 		 415 aa  775    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  59.81 
 
 		 420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  37.31 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  36.04 
 
 		 410 aa  213  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  34.28 
 
 		 404 aa  209  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  34.28 
 
 		 414 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  32.99 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  33.76 
 
 		 409 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  33.08 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  35.23 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  33.85 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  33.59 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  32.85 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  32.85 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  32.16 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  34.11 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  32.3 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  33.33 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.31 
 
 		 417 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  30.15 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  32.82 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  32.82 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  32.73 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  30.33 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  30.26 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.9 
 
 		 400 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  27.09 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.9 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  30.1 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.16 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.38 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  31.14 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  31.68 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  31.69 
 
 		 412 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  32.45 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  26.18 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.86 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  31.83 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  30.65 
 
 		 412 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  29.55 
 
 		 421 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.62 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  31.53 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  29.07 
 
 		 382 aa  123  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.2 
 
 		 429 aa  123  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  30.37 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  31.32 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  26.89 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.86 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.86 
 
 		 370 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.32 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.16 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.01 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.49 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  24.61 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  26.7 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.86 
 
 		 417 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.99 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.97 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.51 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.5 
 
 		 397 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.51 
 
 		 754 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  26.46 
 
 		 374 aa  99  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  25 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  25.13 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.7 
 
 		 386 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  32.76 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.76 
 
 		 389 aa  96.3  9e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.77 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.95 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  26.41 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  25.65 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  29.66 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0043  ROK family protein  32.93 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  28.96 
 
 		 403 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.49 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  27.41 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.82 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  29.18 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.17 
 
 		 403 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.31 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.06 
 
 		 385 aa  90.9  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  28.86 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.4 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  27.24 
 
 		 389 aa  90.1  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  27.79 
 
 		 405 aa  89.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  26.27 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  30.36 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
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NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  26.15 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
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NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  29.6 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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