More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0665 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  100 
 
 		 376 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  94.68 
 
 		 376 aa  728    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  53.7 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  47.57 
 
 		 374 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  47.79 
 
 		 375 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  41.05 
 
 		 383 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  36.31 
 
 		 383 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  36.07 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  31.52 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  32.02 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 387 aa  179  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.3 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  32.61 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  30.4 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  32.61 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  29.75 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  29.75 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  30.59 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.33 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  28.83 
 
 		 367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.84 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.55 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  28.99 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  29.19 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.57 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  27.47 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  26.79 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  25.58 
 
 		 404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.52 
 
 		 418 aa  119  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  29.06 
 
 		 409 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  27.57 
 
 		 413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  27.57 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  28.61 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  30.38 
 
 		 407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  29.06 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  27.3 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  28.03 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.62 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.07 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  26.77 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  28.76 
 
 		 421 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.09 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  25 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  27.27 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  26.53 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  25.27 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  26.88 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.76 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  25.54 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_03250  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 233 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.84 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.75 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  26.36 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  27.73 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  25.61 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.94 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  25.41 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  26.4 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  26.06 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  26.06 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  26.59 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  24.86 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  30.3 
 
 		 420 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  25.76 
 
 		 415 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  26.28 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  30.12 
 
 		 754 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  25.2 
 
 		 415 aa  97.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.41 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  25.2 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  26.32 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  26.32 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.98 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  26.91 
 
 		 416 aa  96.3  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  25.99 
 
 		 418 aa  95.5  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  25.98 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  26.5 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.22 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.65 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.22 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  26.84 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  24.81 
 
 		 413 aa  92.8  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  27.33 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.7 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.91 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  25 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.4 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  26.56 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.09 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  25.08 
 
 		 396 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  23.79 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  27.71 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  28.25 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  23.51 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.74 
 
 		 473 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  28.76 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  29.44 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.83 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  26.18 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
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