More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0233 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  86.95 
 
 		 407 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  86.95 
 
 		 407 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  100 
 
 		 421 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  50 
 
 		 398 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  48.39 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  51.92 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  49.61 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  49.87 
 
 		 409 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  48.95 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  49.21 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  46.19 
 
 		 413 aa  346  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  46.17 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  48.85 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  40.27 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  46.03 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  43.08 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  38.52 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  39.06 
 
 		 404 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  40.72 
 
 		 414 aa  263  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  41.78 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  40.62 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  39.39 
 
 		 410 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  40.99 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  40.95 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  36.13 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.27 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.27 
 
 		 416 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  32.06 
 
 		 416 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  32.23 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  30.23 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  30.23 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  29.34 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.71 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  30.31 
 
 		 404 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  33.05 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  29.66 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  29.66 
 
 		 415 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  32.18 
 
 		 391 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  29.38 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  33.07 
 
 		 401 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  33.33 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  30.95 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.18 
 
 		 418 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.95 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  30.29 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  29.3 
 
 		 376 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.85 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.43 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  26.94 
 
 		 412 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  29.7 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  27.3 
 
 		 412 aa  123  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  28.49 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  30.09 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  28.73 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.33 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  25.7 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  25.57 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.16 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.53 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  25.68 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  25.68 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.05 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.38 
 
 		 429 aa  96.7  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  33.2 
 
 		 754 aa  96.3  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  29.33 
 
 		 367 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.8 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  26.1 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.69 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.86 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  28.02 
 
 		 374 aa  90.1  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  25.85 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.61 
 
 		 375 aa  89.7  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.6 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31 
 
 		 404 aa  87  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  22.85 
 
 		 410 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  27.84 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  29.55 
 
 		 416 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.07 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.32 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.81 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.08 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.46 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  25.92 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.46 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.86 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  32.2 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.46 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.25 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.3 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.82 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  27.43 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  30.1 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  24.71 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  27.46 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  23.06 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  22.87 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  20.31 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.47 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  32.95 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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