More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1485 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  100 
 
 		 385 aa  763    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  33.33 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  33.33 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  30.77 
 
 		 367 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  24.7 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  28.64 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  28.21 
 
 		 389 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  29.06 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  24.86 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4501  ROK  24.86 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  32.2 
 
 		 425 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  28.8 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  25.07 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  28.69 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  25.54 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  27.25 
 
 		 416 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  27.25 
 
 		 416 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  26.75 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  26.98 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  33.51 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  26.79 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.74 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  25.21 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  28.42 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1372  ROK  27.32 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  26.98 
 
 		 415 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  27.67 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  26.98 
 
 		 415 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.21 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25.61 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  26.69 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  26.98 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  26.69 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  27.63 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  28.4 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  26.88 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  26.49 
 
 		 413 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  25.45 
 
 		 416 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  26.44 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  28.45 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  28.7 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  26.25 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  25.48 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.73 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  25.92 
 
 		 382 aa  90.9  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.02 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  25 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  26.06 
 
 		 379 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  27.39 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.32 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  27.32 
 
 		 411 aa  89.4  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  26.72 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  25.9 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  28.13 
 
 		 398 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  26.76 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  27.05 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  23.82 
 
 		 410 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  30.52 
 
 		 402 aa  86.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  23.78 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  27.86 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  24.62 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  24.81 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  25.06 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.61 
 
 		 754 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.44 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.11 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.92 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  26.47 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  26.17 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0913  ROK family protein  24.7 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  24.52 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  28.69 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  24.93 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  25.4 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.61 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  24.7 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  27.43 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.5 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  28.92 
 
 		 381 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  23.56 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  26.4 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  25.42 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  27.76 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.08 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  23.92 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  21.27 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  25 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  22.66 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  27.57 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  30 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  25.51 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
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NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  24.73 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  23.48 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  23.78 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.56 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
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NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  24.66 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.54 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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