More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0206 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  100 
 
 
404 aa  821    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  31.35 
 
 
405 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  30.83 
 
 
434 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.26 
 
 
409 aa  169  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30 
 
 
410 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.24 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  27.74 
 
 
408 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.64 
 
 
414 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30 
 
 
400 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  29.16 
 
 
406 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.89 
 
 
389 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.61 
 
 
406 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  28.39 
 
 
406 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  28.64 
 
 
401 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  29.08 
 
 
408 aa  150  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  29.08 
 
 
408 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  29.08 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.53 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 
406 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 
406 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 
406 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 
406 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 
406 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.96 
 
 
391 aa  144  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.64 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  31.28 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.86 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  25.94 
 
 
402 aa  139  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  28.46 
 
 
407 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.39 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.94 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.46 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.43 
 
 
398 aa  137  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  29.56 
 
 
404 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.44 
 
 
416 aa  136  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.07 
 
 
396 aa  136  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.64 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  29.72 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  28.72 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  27.18 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.93 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.58 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  26.22 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  25.63 
 
 
389 aa  133  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.82 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  27.44 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.6 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.79 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.98 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.25 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.09 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.22 
 
 
387 aa  130  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  30.31 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  25.71 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  26.22 
 
 
406 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  26.22 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.85 
 
 
364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  26.22 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.46 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  26.7 
 
 
408 aa  127  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.61 
 
 
392 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  25.97 
 
 
406 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.75 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  28.35 
 
 
323 aa  126  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  25.97 
 
 
406 aa  126  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  28.25 
 
 
395 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.02 
 
 
390 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.69 
 
 
399 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  25.92 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  25.92 
 
 
406 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  24.27 
 
 
381 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  27.02 
 
 
405 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  25.92 
 
 
406 aa  123  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  26.2 
 
 
405 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  27.13 
 
 
417 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  26.15 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  26.15 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  26.15 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  26.34 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  26.79 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  26.15 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  26.15 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  26.15 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  26.46 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  26.3 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  25.76 
 
 
399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  26.32 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  23.38 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.52 
 
 
408 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.3 
 
 
407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.25 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.19 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>