More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1344 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  100 
 
 		 367 aa  728    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  80.79 
 
 		 367 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  40.11 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  30.11 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  30.11 
 
 		 370 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  31.02 
 
 		 404 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.5 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  29.38 
 
 		 417 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  27.78 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  32.62 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  28.02 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  30.09 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.78 
 
 		 429 aa  115  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  27.44 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  30.56 
 
 		 421 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  29.61 
 
 		 379 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  29.94 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.76 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  28.69 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  29.09 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  28.2 
 
 		 409 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  33.33 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  32.19 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  31.76 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  32.92 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.46 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  31.76 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  31.76 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  29.13 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  31.76 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  31.76 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  28.34 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.08 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  33.06 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  30.17 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  28.35 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  25.6 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.04 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  32.79 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
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NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  31.17 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  26.03 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.96 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  29.6 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  29.6 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.71 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  28.74 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.83 
 
 		 401 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  30.47 
 
 		 417 aa  99.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  26.82 
 
 		 400 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  29.36 
 
 		 754 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_1899  ROK  25.38 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.16 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  32.19 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  23.62 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  32.81 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  31.98 
 
 		 414 aa  97.1  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.09 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  26.07 
 
 		 414 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  30.77 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  25.95 
 
 		 410 aa  95.5  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  27.12 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.13 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  27.63 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.13 
 
 		 409 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  26.29 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  25.84 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.48 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  26.2 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
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NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  30.38 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  30.36 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  31.71 
 
 		 473 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.38 
 
 		 393 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.08 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  27.27 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  25.15 
 
 		 404 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  27.06 
 
 		 374 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.79 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.21 
 
 		 443 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  28.89 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.22 
 
 		 401 aa  90.5  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.82 
 
 		 418 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  26.89 
 
 		 396 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  30.84 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.57 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  25.13 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.79 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  29.82 
 
 		 403 aa  89  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0891  ROK family protein  27.17 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.53 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.21 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.17 
 
 		 387 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.36 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  27.92 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  27.57 
 
 		 399 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  27.06 
 
 		 410 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  27.27 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  29.51 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0891  ROK  28.28 
 
 		 413 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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