More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0891 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  100 
 
 		 413 aa  830    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  96.57 
 
 		 408 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  89 
 
 		 416 aa  693    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  52.15 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  52.39 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  52.55 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  55.22 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  50.38 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  48.88 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  40.4 
 
 		 439 aa  276  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  41.78 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  37.75 
 
 		 415 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  37.84 
 
 		 415 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  38.22 
 
 		 411 aa  262  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  37.44 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  42.34 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  37.91 
 
 		 409 aa  256  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  36.55 
 
 		 410 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  37.96 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  42.56 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  37.5 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
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NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  34.78 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  34.31 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  35.28 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  32.73 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  32.73 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  33.33 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  33.33 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  30.71 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  33.25 
 
 		 416 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  32.82 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
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NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  32.82 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  32.82 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  32.56 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  31.06 
 
 		 391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  32.73 
 
 		 416 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  33.41 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  28.22 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.6 
 
 		 400 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  30.05 
 
 		 412 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.76 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  29.02 
 
 		 400 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  31.19 
 
 		 401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  31.03 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.94 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  29.01 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  30.27 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_007005  Psyr_4501  ROK  28.73 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  28.03 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  28.11 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.51 
 
 		 409 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  27.82 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  28.84 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  28.28 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  28.49 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  25.5 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.3 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  28.53 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  26.98 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  26.98 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  27.36 
 
 		 754 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  26.68 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.99 
 
 		 414 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  32.26 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  29.53 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.97 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.29 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  23.68 
 
 		 421 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  25.38 
 
 		 401 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  23.95 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  30.43 
 
 		 389 aa  99  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  31.5 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3037  ROK family protein  23.02 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  25.72 
 
 		 378 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  27.19 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  31.97 
 
 		 399 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  25.36 
 
 		 409 aa  93.2  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  29.46 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  29.1 
 
 		 424 aa  90.9  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  27.03 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.68 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  25.76 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  27.78 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.31 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  28.87 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  28.22 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  26.86 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  21.84 
 
 		 410 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.39 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.86 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  25.06 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
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NC_010816  BLD_1887  NagC family Transcriptional regulator  24.65 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103401  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  26.13 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
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NC_013172  Bfae_01930  transcriptional regulator/sugar kinase  28.63 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  33.08 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  26.87 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
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NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  29.03 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
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NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  26.69 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
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