More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2651 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  100 
 
 		 407 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  100 
 
 		 407 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  86.95 
 
 		 421 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  53.26 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  51.18 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_1372  ROK  48.68 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  51.43 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  51.05 
 
 		 415 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  51.58 
 
 		 409 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  50.79 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  50.26 
 
 		 410 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  45.91 
 
 		 413 aa  344  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  46.75 
 
 		 411 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  39.73 
 
 		 390 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  45.77 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  42.36 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  40.93 
 
 		 404 aa  273  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3351  ROK family protein  40.94 
 
 		 407 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  39.37 
 
 		 409 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3207  hypothetical protein  40.67 
 
 		 414 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0193804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  42.34 
 
 		 413 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  39.55 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  41.21 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  40.82 
 
 		 422 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
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NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  35.6 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  31.87 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  31.87 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  31.44 
 
 		 416 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  31.7 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007347  Reut_A1654  ROK  33.61 
 
 		 420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  33.93 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  31.83 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  29.71 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  30.2 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  29.71 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.71 
 
 		 415 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  31.9 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  29.14 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  29.14 
 
 		 415 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  28.86 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  34.02 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  31.61 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  31.76 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  33.04 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.2 
 
 		 418 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_007005  Psyr_4501  ROK  30.65 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.43 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  30.2 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  30.38 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  27.86 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  29.7 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2589  ROK  30.93 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  30.11 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
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NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  30.7 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  27.58 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  26.39 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  28.97 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.49 
 
 		 414 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  27.37 
 
 		 382 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  27.52 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  27.52 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.08 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.3 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  29.27 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.55 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.85 
 
 		 417 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  27.68 
 
 		 397 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.01 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.25 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  30.62 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.79 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  31.84 
 
 		 754 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.5 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  26.79 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  25.79 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1381  ROK family protein  33.99 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.917088  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  23.81 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  30.11 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.57 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.54 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.12 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.34 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  32.26 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  29.86 
 
 		 414 aa  87.8  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.04 
 
 		 404 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.57 
 
 		 404 aa  86.7  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  25.23 
 
 		 380 aa  86.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  29.63 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  26.29 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  27.6 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_01250  transcriptional regulator/sugar kinase  26.94 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  25.77 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.53 
 
 		 389 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.55 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  25.81 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  27.91 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.38 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  30.34 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
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NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  23.47 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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