More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03328 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03328  ROK family protein  100 
 
 		 382 aa  753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4501  ROK  32.05 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0665  ROK family protein  31.52 
 
 		 376 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2182  transcriptional regulator ROK family  34.69 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2352  ROK family protein  34.12 
 
 		 383 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.305071  normal  0.103428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1870  ROK family protein  34.59 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2090  ROK family protein  33.42 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5363  ROK family protein  33.16 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.158793  normal  0.68624 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03375  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0337  ROK domain-containing protein  27.54 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5083  ROK family protein  33.07 
 
 		 383 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.122916  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  30 
 
 		 417 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  30.32 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  30.4 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  31.02 
 
 		 418 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  31.12 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2864  ROK family protein  29.81 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  30.7 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  30.85 
 
 		 416 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6013  ROK family protein  26.95 
 
 		 410 aa  126  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.627937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1757  ROK family protein  28.08 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.24 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  30.35 
 
 		 389 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2166  ROK family protein  26.67 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259459  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2054  ROK family protein  26.67 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1372  ROK  26.75 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.436863  normal  0.250954 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4127  ROK family protein  29.11 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  30.7 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  30.41 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  30.79 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  30.41 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0101  ROK family protein  28.11 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00205324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  31.06 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  30.12 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  30.12 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.82 
 
 		 415 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0506  ROK family protein  30.28 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.76 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0367  ROK domain-containing protein  27.76 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0233  ROK family protein  29.09 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.585824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0068  ROK family protein  27.27 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.657288  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  29.15 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3595  ROK family protein  29.3 
 
 		 416 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  29.2 
 
 		 409 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03610  ROK (Repressor, ORF, Kinase) domain protein  27.05 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.759282  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.5 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0125  ROK family protein  26.68 
 
 		 415 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2418  ROK family protein  26.93 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149199  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0124  ROK family protein  26.95 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84663  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4578  ROK family protein  30.21 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.104261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0991  ROK family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.819596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2651  ROK family protein  27.58 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0891  ROK  30.18 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5249  transcriptional regulator ROK family  26.33 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5972  transcriptional regulator ROK family  26.27 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.248958  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2607  ROK family protein  27.3 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.95 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.43 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1654  ROK  25.07 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.06 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7333  transcriptional regulator ROK family  27.43 
 
 		 412 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.777394  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.87 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4719  ROK family protein  26.3 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03250  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 233 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  28.15 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1899  ROK  26.4 
 
 		 409 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0996868  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  28.1 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.68 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.14 
 
 		 389 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00665  transcriptional regulator, ROK family protein  22.52 
 
 		 390 aa  90.1  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  27.76 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0536  ROK family protein  26.84 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.96 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.22 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  34.05 
 
 		 417 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.61 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2225  ROK family protein  32.24 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158605 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  26.32 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  27.78 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  31.06 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  26.32 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  24.7 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1344  ROK family protein  27.12 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0409693  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1485  ROK family protein  27.33 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177239  normal  0.920593 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  28.77 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  29.68 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4692  ROK family protein  26.09 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.476494 
 
 
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NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.06 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
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NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.33 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  21.3 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  28.45 
 
 		 393 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  25.54 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
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NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.77 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.92 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011368  Rleg2_4697  putative transcriptional regulator protein, ROK family  26.87 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.925334 
 
 
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NC_012848  Rleg_4714  putative transcriptional regulator protein, ROK family  25.67 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.26 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
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NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  25.23 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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